Com esta formação pretende-se dinamizar a aquisição de conhecimento numa área inovadora e em franca expansão – o rastreio de alto rendimento. A sua acreditação como formação contínua permitirá assegurar o interesse, a eficácia e a qualidade da formação realizada, e promoverá a interdisciplinaridade dentro da UP, particularmente nas áreas de Engenharia e das Ciências Biológicas e Biomédicas.
Com uma duração total de 5 dias, esta formação tem uma orientação fundamentalmente prática, encorajando os participantes à utilização de diferentes técnicas de aquisição massiva de imagens e à análise específica das imagens obtidas com recursos aos diversos softwares disponíveis.
Tendo a possibilidade de interagir com especialistas nacionais e internacionais na área da análise de imagem, o objetivo fulcral desta unidade de formação é permitir que os participantes adquiram conhecimentos para desenhar, realizar e interpretar experiências onde seja fundamental a análise de imagem em geral e a citometria de fluxo com capacidade de aquisição de imagens e microscopia de high content em particular.
Objetivos:
Pretende-se que os participantes adquiram as seguintes competências:
- Uma visão integradora da aplicação da bioimagem na investigação nas áreas da medicina regenerativa, biomateriais e ciências biológicas;
- Conhecimentos aprofundados sobre uma ferramenta cada vez mais utilizada na aquisição e análise de imagem aplicadas às áreas da biologia celular, imunologia, engenharia de tecidos, biomateriais, modelos pré-clínicos, etc.;
- Destreza no planeamento e realização de experiências utilizando as técnicas de citometria de fluxo com capacidade de aquisição de imagens (ex. Imagestream) e de microscopia de high content (ex. IN Cell Analyzer 2000);
- Analisar e interpretar os resultados obtidos na análise das imagens com recurso aos softwares de utilização livre amplamente difundidos na comunidade científica para análise de imagem de microscopia: ImageJ , ilastik e Cell profiler.
Programa:
Fundamentos e utilização do microscópio de high content (IN Cell Analyzer 2000). Formação no software específico do equipamento para aquisição de amostras.
Fundamentos e utilização do software de análise de imagens adquiridas no imagestream com o software IDEAS (software próprio do equipamento). Este software é completamente gratuito na sua versão completa para toda a comunidade científica.
Fundamentos e utilização do software de análise de imagens adquiridas no IN Cell Analyzer 2000 com o software próprio do equipamento.
Introdução à utilização do software CellProfiler para a análise de imagens obtidas com o Imagestream e IN Cell Analyzer (batch analysis entre outros). Práticas com os exemplos analisados nos softwares dos equipamentos.
Fundamentos de utilização do software ilastik para a análise de imagens obtidas com o INCell Analyzer (machine learning). Práticas com os exemplos analisados nos softwares dos equipamentos.
Fundamentos de preparação e desenvolvimento de projetos, na área de rastreios químicos e genéticos de larga escala.
Destinatários:
Esta formação foi concebida para todos os estudantes/investigadores das áreas de Medicina Regenerativa, Engenharia Biomédica, Biomateriais, Bioengenharia, Neurociências, Oncobiologia, Biologia Celular e Análise de Imagem.
Está aberta à participação de estudantes de pós-graduação (Mestrado, Programa doutoral) e investigadores das referidas áreas, provenientes de laboratórios de investigação, instituições de ensino superior e empresas.
Condições de acesso:
Formação universitária em áreas afins a Medicina Regenerativa, Engenharia Biomédica, Biomateriais, Biologia Celular e Análise de Imagem.
Os candidatos deverão estar inscritos em mestrado ou programa doutoral.
Os candidatos serão selecionados de acordo com o currículo e carta de motivação apresentados aquando da candidatura. Como critério principal será dada preferência aqueles candidatos para os quais a utilização dos equipamentos e a formação na análise de imagem sejam fundamentais para o seu trabalho de investigação.
Os candidatos serão avaliados pelo CV e a carta de motivação com uma avaliação máxima de 4 pontos, soma dos valores obtidos para cada um dos critérios mencionados a seguir:
Cada critério será avaliado com um valor de 1 quando o candidato satisfaça o critério, e de 0 em caso contrario.
Avaliação e certificação:
A avaliação dos estudantes será efetuada através de Prova de avaliação, sendo a classificação positiva expressa na escala de 10 a 20 (nº 10, artº 5º do Regulamento de criação de cursos da UP).
A presença é obrigatória nos cinco dias da formação, sendo essencial para poder realizar a prova de avaliação.Créditos: 2 ECTS (Creditado pela UP em 2017.06.06)
Duração: 54 h (36 h de contato)
Datas:
23 a 27 de maio de 2022
Local:
i3S - Instituto de Investigação e Inovação em Saúde
Universidade do Porto - Campus da Asperela
Rua Alfredo Allen, 208
4200-135 Porto, Portugal
Participantes: 20 (máximo) 10 (mínimo)
Custo: 250¤ (inscrição antecipada) | 350¤ (inscrição normal)
Mais informações:
Email: b.image@ineb.up.pt (Dr Maria Lázaro)
Telefone: +351-220408800 (Dr Maria Lázaro)
Website: https://www.i3s.up.pt/training-detail.php?v=155
Sigla: | RLEAICB |
Tipo de curso/ciclo de estudos: | Unidade de Formação Contínua |
Início: | 2017/2018 |
Duração: | 36 Horas |